这八大科技工程分别是：新型工业化科技引领工程、现代农牧业科技支撑工程、民生科技工程、资源与环境科技工程、区域创新体系建设工程、科技创新能力提升工程、科技人才队伍建设工程和国际科技合作工程。
由于历史、社会等多方面因素影响，新疆科技总体水平在全国尚处于落后地位。“十二五”是新疆抓住机遇、迎接挑战、实现经济社会跨越式发展的重要时期，对科技的支撑引领提出新的更高要求。
新疆维吾尔自治区科技厅厅长张小雷在接受采访时表示，“十二五”部署的重大科技工程是通过对新疆经济社会发展的重大科技需求的分析，梳理制约当地优势特色产业发展的重大技术问题，力争在产业竞争力整体提升影响大、带动性强的关键共性技术方面取得突破，实现以科技发展的局部跃升带动生产力的跨越式发展而提出的。
在实施新型工业化科技引领工程中，新疆将建石油化工新材料、稀有和有色金属新材料、煤洁净转化、大型风电装备制造、电子信息和生物医药等２０个高新技术产业化基地。
新疆将“十二五”开局之年定为“民生建设年”，在民生科技工程中，将人口与健康的关键技术研发与示范放在了突出的位置，包括重大传染病研究和防控治疗技术，高发病和地方病预防及诊疗技术，中医、民族医和西医结合治疗关键技术以及人畜共患病防治技术等。
随着新一轮援疆工作有序展开，科技援疆将在援疆工作的整体部署中发挥着重要作用。科技部加大对新疆科技支持，推出五项重大举措：国家各项科技计划向新疆倾斜支持、加大对新疆创新基础能力的支持、支持新疆科技人才队伍建设、加快推动新疆特色优势产业发展以及营造新疆跨越式发展的创新环境。
此外，科技部还编制了《全国科技援疆规划（２０１１－２０２０）》，这也是科技部第一次编制援疆规划。《规划》框架提出，紧密围绕新疆跨越式发展和长治久安的科技需求，从现代农牧业发展、高新技术研发及产业聚集园区建设、矿产资源勘查和开发利用、民生科技、可持续发展和生态文明建设等８个方面加强科技援疆任务部署，集成全国科技资源共同组织实施。
